В статье представлены методические подходы к разработке механизма формирования и развития национальной и региональной инновационной системы. Мировые экономические процессы интеграции и глобализации ориентированы на современные конкурентоспособные знания, науку, технологии и производства. Регионы оказываются вовлеченными не только в процессы на уровне отдельной страны, но и испытывают влияние глобальных экономических явлений.