На основе анализа собственных материалов и литературных данных установлено обитание 9 малочисленных видов пресмыкающихся на территории автономной республики. Из обнаруженных видов один принадлежит группе черепах (Testudines), 3-группе ящериц (Sauria) и 5-группе (Serpentes). В статье отражены систематика, экологические и некоторые биологические особенности видов. За годы исследований ранее отмеченный Psammophis lineolatus обнаружен не был и даже его существование в территории Нахчыванской АР ставится под сомнение.